简而言之就是人类在亚当、莉莉丝沉睡时将其控制。
46亿年前亚当之卵白之月降落地球南极，第一使徒亚当孕育了其它14个使徒。
40亿年前莉莉丝之卵黑之月撞击地球南极附近，造成的冲击波使亚当和其它使徒沉睡，【部分物质进入太空形成月球，史称第一次冲击。冲击后莉莉丝释放LCL，人类诞生。后由于板块漂移，黑之月来到今日本神奈川县箱根】。
2000年葛城科考队进入南极白之月,发现亚当和朗基努斯之枪。拔除朗基努斯之枪，对亚当进行人类基因接触实验，造成亚当苏醒。试图插回朗枪抑制，失败，【人为诱发S2机关暴走】，二冲爆发（目的是防止反AT力场释放造成人类全灭）。
随后亚当再次沉睡，seele将其还原为胚胎。这段时间内亚当根据被注入体内的人类基因创造出第十七使徒——自由天使渚薰。
B. 关于eva亚当和莉莉丝的的问题，骨灰级的粉丝期待你们回答(*^__^*)
1、莉莉丝是上帝造的亚当的第一任妻子，后来堕落为撒旦的妻子，并和撒旦生下lilin，即人类，之后上帝又造了夏娃作为亚当的妻子
2、亚当和莉莉丝分别被封在黑之月和白之月之中，黑之月在南极，白之月在第三新东京市
3、相当于最终审判
4、2000年的爆炸并不是因为融合引起的，而是试图使用朗基努斯枪分离亚当的s2机关导致爆炸
5、传说谁控制融合的过程，就可以实现自己的愿望，定远渡希望成为神，再见到唯；seele希望所有人失去肉体，精神融合，真正补完，当然如果使徒融合了，可能就会满足使徒的愿望，而人类肯定会被消灭，所以要保护
6、可以
7、渚薰和绫波丽一样，只是灵魂的容器，他是SEELE控制的，被灌入了亚当的灵魂
8、最初觉得可能有平行世界的关系，现在看来很难说，估计得到最后一部才能明了
更详细的解释可以去eva吧看解惑贴，那里各种大神……