簡而言之就是人類在亞當、莉莉絲沉睡時將其控制。
46億年前亞當之卵白之月降落地球南極，第一使徒亞當孕育了其它14個使徒。
40億年前莉莉絲之卵黑之月撞擊地球南極附近，造成的沖擊波使亞當和其它使徒沉睡，【部分物質進入太空形成月球，史稱第一次沖擊。沖擊後莉莉絲釋放LCL，人類誕生。後由於板塊漂移，黑之月來到今日本神奈川縣箱根】。
2000年葛城科考隊進入南極白之月,發現亞當和朗基努斯之槍。拔除朗基努斯之槍，對亞當進行人類基因接觸實驗，造成亞當蘇醒。試圖插回朗槍抑制，失敗，【人為誘發S2機關暴走】，二沖爆發（目的是防止反AT力場釋放造成人類全滅）。
隨後亞當再次沉睡，seele將其還原為胚胎。這段時間內亞當根據被注入體內的人類基因創造出第十七使徒——自由天使渚薰。
B. 關於eva亞當和莉莉絲的的問題，骨灰級的粉絲期待你們回答(*^__^*)
1、莉莉絲是上帝造的亞當的第一任妻子，後來墮落為撒旦的妻子，並和撒旦生下lilin，即人類，之後上帝又造了夏娃作為亞當的妻子
2、亞當和莉莉絲分別被封在黑之月和白之月之中，黑之月在南極，白之月在第三新東京市
3、相當於最終審判
4、2000年的爆炸並不是因為融合引起的，而是試圖使用朗基努斯槍分離亞當的s2機關導致爆炸
5、傳說誰控制融合的過程，就可以實現自己的願望，定遠渡希望成為神，再見到唯；seele希望所有人失去肉體，精神融合，真正補完，當然如果使徒融合了，可能就會滿足使徒的願望，而人類肯定會被消滅，所以要保護
6、可以
7、渚薰和綾波麗一樣，只是靈魂的容器，他是SEELE控制的，被灌入了亞當的靈魂
8、最初覺得可能有平行世界的關系，現在看來很難說，估計得到最後一部才能明了
更詳細的解釋可以去eva吧看解惑貼，那裡各種大神……